Chiều dài cơ thể lớn nhất được ghi nhận ở H. maya là 9,4 cm[1]. Đầu và thân có màu xanh lam đậm, có ánh kim; vây nhạt màu hơn và không có viền đen[3]. Loài cá này có màu sắc tương tự như Hypoplectrus gemma, nhưng H. gemma có viền đen ở rìa trên và dưới của vây đuôi[2]. Màu sắc của H. maya cũng khá tương đồng với loài hải tiêu Clavelina puertosecensis (mọc trên các rễ cây), giúp H. maya có thể ngụy trang để trốn các loài săn mồi[2].

Số gai ở vây lưng: 10; Số tia vây mềm ở vây lưng: 14 - 15; Số gai ở vây hậu môn: 3; Số tia vây mềm ở vây hậu môn: 6 - 7; Số gai ở vây bụng: 1; Số tia vây mềm ở vây bụng: 5; Số vảy đường bên: 48 - 53; Số lược mang: 17 - 23[2][3].